MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 chromosome

Total Repeats: 62218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014833	ATG	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
2	NC_014833	TGA	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
3	NC_014833	AAT	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054732
4	NC_014833	CTG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054732
5	NC_014833	CAG	2	6	193	198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054732
6	NC_014833	GAA	2	6	238	243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054732
7	NC_014833	GAT	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
8	NC_014833	AGG	2	6	296	301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054732
9	NC_014833	AAG	2	6	304	309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054732
10	NC_014833	TA	3	6	353	358	50 %	50 %	0 %	0 %	317054732
11	NC_014833	ATG	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
12	NC_014833	ATC	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054732
13	NC_014833	CTT	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054732
14	NC_014833	GAT	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
15	NC_014833	ATC	2	6	694	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054732
16	NC_014833	TTC	2	6	727	732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054732
17	NC_014833	CAGGA	2	10	814	823	40 %	0 %	40 %	20 %	317054732
18	NC_014833	CAA	2	6	827	832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054732
19	NC_014833	TAA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054732
20	NC_014833	CTG	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054732
21	NC_014833	GTA	2	6	940	945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
22	NC_014833	GAT	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
23	NC_014833	AAGA	2	8	1200	1207	75 %	0 %	25 %	0 %	317054732
24	NC_014833	TA	5	10	1212	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	317054732
25	NC_014833	GAAG	2	8	1224	1231	50 %	0 %	50 %	0 %	317054732
26	NC_014833	CCA	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317054732
27	NC_014833	ACAA	2	8	1327	1334	75 %	0 %	0 %	25 %	317054732
28	NC_014833	ATA	2	6	1383	1388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054732
29	NC_014833	ATA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054733
30	NC_014833	ATG	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054733
31	NC_014833	AAG	2	6	2048	2053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054733
32	NC_014833	CGA	2	6	2054	2059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054733
33	NC_014833	GAT	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054733
34	NC_014833	AAG	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054733
35	NC_014833	TGA	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054733
36	NC_014833	GATA	2	8	2132	2139	50 %	25 %	25 %	0 %	317054733
37	NC_014833	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054733
38	NC_014833	TACCCT	2	12	2363	2374	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	317054733
39	NC_014833	TC	4	8	2460	2467	0 %	50 %	0 %	50 %	317054733
40	NC_014833	ACT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054733
41	NC_014833	TA	3	6	2511	2516	50 %	50 %	0 %	0 %	317054733
42	NC_014833	CGG	2	6	2549	2554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054733
43	NC_014833	AT	3	6	2555	2560	50 %	50 %	0 %	0 %	317054733
44	NC_014833	TGC	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054733
45	NC_014833	TCA	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054733
46	NC_014833	TCTCCT	2	12	2700	2711	0 %	50 %	0 %	50 %	317054733
47	NC_014833	TAC	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054733
48	NC_014833	CCT	2	6	2837	2842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317054733
49	NC_014833	GGC	2	6	2889	2894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054733
50	NC_014833	CTG	2	6	2898	2903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054733
51	NC_014833	TTC	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054733
52	NC_014833	GA	3	6	2969	2974	50 %	0 %	50 %	0 %	317054733
53	NC_014833	TAA	2	6	2976	2981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054733
54	NC_014833	AGAA	2	8	3013	3020	75 %	0 %	25 %	0 %	317054734
55	NC_014833	TAG	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054734
56	NC_014833	GAA	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054734
57	NC_014833	TCT	2	6	3303	3308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054735
58	NC_014833	A	6	6	3313	3318	100 %	0 %	0 %	0 %	317054735
59	NC_014833	GCG	2	6	3363	3368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054735
60	NC_014833	GCA	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054735
61	NC_014833	CGA	3	9	3409	3417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054735
62	NC_014833	A	6	6	3504	3509	100 %	0 %	0 %	0 %	317054735
63	NC_014833	CGG	2	6	3556	3561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054735
64	NC_014833	AGA	2	6	3623	3628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054735
65	NC_014833	CTG	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054735
66	NC_014833	GGCAGA	2	12	3740	3751	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	317054735
67	NC_014833	AGA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054735
68	NC_014833	TA	3	6	3800	3805	50 %	50 %	0 %	0 %	317054735
69	NC_014833	CTG	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054735
70	NC_014833	GGC	2	6	3875	3880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054735
71	NC_014833	ATT	3	9	3900	3908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317054735
72	NC_014833	ATA	2	6	3993	3998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054735
73	NC_014833	CGA	2	6	4000	4005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054735
74	NC_014833	GA	3	6	4081	4086	50 %	0 %	50 %	0 %	317054735
75	NC_014833	TCC	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317054735
76	NC_014833	GAG	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054735
77	NC_014833	ATC	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054735
78	NC_014833	TCC	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317054735
79	NC_014833	CTG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054735
80	NC_014833	TGA	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054735
81	NC_014833	A	6	6	4346	4351	100 %	0 %	0 %	0 %	317054735
82	NC_014833	AAG	2	6	4397	4402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054736
83	NC_014833	TGT	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054736
84	NC_014833	AGA	2	6	4473	4478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054736
85	NC_014833	A	6	6	4510	4515	100 %	0 %	0 %	0 %	317054736
86	NC_014833	AGA	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054736
87	NC_014833	TG	3	6	4601	4606	0 %	50 %	50 %	0 %	317054736
88	NC_014833	TGA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054736
89	NC_014833	GTA	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054737
90	NC_014833	GAAAA	2	10	4850	4859	80 %	0 %	20 %	0 %	317054737
91	NC_014833	A	6	6	4856	4861	100 %	0 %	0 %	0 %	317054737
92	NC_014833	GAA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054737
93	NC_014833	GAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054737
94	NC_014833	ATA	2	6	4994	4999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054737
95	NC_014833	CTT	2	6	5067	5072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054737
96	NC_014833	A	7	7	5238	5244	100 %	0 %	0 %	0 %	317054738
97	NC_014833	TG	3	6	5290	5295	0 %	50 %	50 %	0 %	317054738
98	NC_014833	TGA	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054738
99	NC_014833	TA	4	8	5325	5332	50 %	50 %	0 %	0 %	317054738
100	NC_014833	AGCTG	2	10	5337	5346	20 %	20 %	40 %	20 %	317054738
101	NC_014833	CTG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054738
102	NC_014833	ATA	2	6	5403	5408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054739
103	NC_014833	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054739
104	NC_014833	ACG	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054739
105	NC_014833	GTAT	2	8	5526	5533	25 %	50 %	25 %	0 %	317054739
106	NC_014833	CGA	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054739
107	NC_014833	ATA	2	6	5627	5632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054739
108	NC_014833	GTT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054739
109	NC_014833	CGG	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054739
110	NC_014833	GGA	2	6	5774	5779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054739
111	NC_014833	GTT	2	6	5819	5824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054739
112	NC_014833	ACT	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054739
113	NC_014833	CTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054739
114	NC_014833	TTC	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054739
115	NC_014833	TA	4	8	6190	6197	50 %	50 %	0 %	0 %	317054739
116	NC_014833	GAT	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054739
117	NC_014833	ATA	2	6	6263	6268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054739
118	NC_014833	AAT	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054739
119	NC_014833	CGG	2	6	6301	6306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054739
120	NC_014833	TCA	2	6	6375	6380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054739
121	NC_014833	GAC	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054739
122	NC_014833	TCG	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054739
123	NC_014833	GAAA	2	8	6529	6536	75 %	0 %	25 %	0 %	317054739
124	NC_014833	GGA	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054739
125	NC_014833	AAG	2	6	6646	6651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054739
126	NC_014833	GCTG	2	8	6688	6695	0 %	25 %	50 %	25 %	317054739
127	NC_014833	GA	4	8	6704	6711	50 %	0 %	50 %	0 %	317054739
128	NC_014833	AT	4	8	6728	6735	50 %	50 %	0 %	0 %	317054739
129	NC_014833	GCGG	2	8	6752	6759	0 %	0 %	75 %	25 %	317054739
130	NC_014833	TGA	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054739
131	NC_014833	CTG	2	6	6995	7000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054739
132	NC_014833	TCT	2	6	7005	7010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054739
133	NC_014833	GAG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054739
134	NC_014833	GAAA	2	8	7079	7086	75 %	0 %	25 %	0 %	317054739
135	NC_014833	GAA	2	6	7115	7120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054739
136	NC_014833	CGG	2	6	7150	7155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054739
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138	NC_014833	GGA	2	6	7267	7272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054739
139	NC_014833	GAA	2	6	7345	7350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054739
140	NC_014833	AT	3	6	7416	7421	50 %	50 %	0 %	0 %	317054740
141	NC_014833	CGG	2	6	7429	7434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054740
142	NC_014833	GAA	2	6	7442	7447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054740
143	NC_014833	AAGA	2	8	7493	7500	75 %	0 %	25 %	0 %	317054740
144	NC_014833	GAA	2	6	7586	7591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054740
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147	NC_014833	GTGCT	2	10	7727	7736	0 %	40 %	40 %	20 %	317054740
148	NC_014833	TG	3	6	7738	7743	0 %	50 %	50 %	0 %	317054740
149	NC_014833	TGA	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054740
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152	NC_014833	TGA	2	6	7797	7802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054740
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157	NC_014833	AAAAG	2	10	8032	8041	80 %	0 %	20 %	0 %	317054740
158	NC_014833	GA	3	6	8056	8061	50 %	0 %	50 %	0 %	317054740
159	NC_014833	AAG	2	6	8070	8075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054740
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161	NC_014833	ATT	2	6	8313	8318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317054741
162	NC_014833	ATG	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054741
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173	NC_014833	TCCC	2	8	9285	9292	0 %	25 %	0 %	75 %	317054742
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249	NC_014833	TGT	2	6	15352	15357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054745
250	NC_014833	GAAA	2	8	15427	15434	75 %	0 %	25 %	0 %	317054745
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252	NC_014833	TC	3	6	15559	15564	0 %	50 %	0 %	50 %	317054745
253	NC_014833	TG	3	6	15657	15662	0 %	50 %	50 %	0 %	317054745
254	NC_014833	TA	3	6	15790	15795	50 %	50 %	0 %	0 %	317054745
255	NC_014833	GAA	2	6	15830	15835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054745
256	NC_014833	GAAA	2	8	16195	16202	75 %	0 %	25 %	0 %	317054746
257	NC_014833	AAG	2	6	16337	16342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054746
258	NC_014833	TGA	3	9	16349	16357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054746
259	NC_014833	CGG	2	6	16433	16438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054746
260	NC_014833	TA	4	8	16507	16514	50 %	50 %	0 %	0 %	317054746
261	NC_014833	TGA	2	6	16523	16528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054746
262	NC_014833	CAG	3	9	16638	16646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054746
263	NC_014833	CTG	2	6	16698	16703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054746
264	NC_014833	TGG	2	6	16729	16734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317054746
265	NC_014833	GAC	2	6	16782	16787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054746
266	NC_014833	ATC	2	6	16815	16820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054746
267	NC_014833	AAG	2	6	16860	16865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054746
268	NC_014833	GAT	2	6	16893	16898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054746
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272	NC_014833	CTG	2	6	17358	17363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054747
273	NC_014833	GAT	2	6	17376	17381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054747
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276	NC_014833	GTT	2	6	17595	17600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054747
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280	NC_014833	AG	4	8	17812	17819	50 %	0 %	50 %	0 %	317054747
281	NC_014833	CTC	2	6	17875	17880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317054747
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283	NC_014833	ATC	2	6	18015	18020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054747
284	NC_014833	AAG	2	6	18063	18068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054747
285	NC_014833	CATCA	2	10	18126	18135	40 %	20 %	0 %	40 %	317054747
286	NC_014833	TCGT	2	8	18184	18191	0 %	50 %	25 %	25 %	317054747
287	NC_014833	AAGG	2	8	18282	18289	50 %	0 %	50 %	0 %	317054747
288	NC_014833	AG	3	6	18301	18306	50 %	0 %	50 %	0 %	317054747
289	NC_014833	ACA	2	6	18355	18360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054747
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293	NC_014833	TATC	2	8	18574	18581	25 %	50 %	0 %	25 %	317054747
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297	NC_014833	GCA	2	6	18777	18782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054747
298	NC_014833	GAG	2	6	18804	18809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054747
299	NC_014833	GCA	2	6	18822	18827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054747
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302	NC_014833	AG	3	6	18879	18884	50 %	0 %	50 %	0 %	317054747
303	NC_014833	AAG	2	6	18891	18896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054747
304	NC_014833	GAA	2	6	18903	18908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054747
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342	NC_014833	GCG	2	6	20358	20363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054748
343	NC_014833	AAT	2	6	20435	20440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054748
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360	NC_014833	TGA	2	6	21514	21519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054749
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362	NC_014833	ATA	2	6	21900	21905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054749
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377	NC_014833	A	6	6	22999	23004	100 %	0 %	0 %	0 %	317054750
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382	NC_014833	GA	3	6	23398	23403	50 %	0 %	50 %	0 %	317054751
383	NC_014833	AGGAT	2	10	23471	23480	40 %	20 %	40 %	0 %	317054751
384	NC_014833	TTC	2	6	23489	23494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054751
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388	NC_014833	GTGG	2	8	23689	23696	0 %	25 %	75 %	0 %	317054751
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